AMEA Mərkəzi Nəbatat Bağı elmi məlumat, toxum və əkin materialları mübadiləsi, birgə elmi tədqiqatlar, konfranslarda iştirak vasitəsilə beynəlxalq əlaqələr yaradır. Mərkəzi Nəbatat Bağı hər il Yaroniya, Almaniya, İsveç, Rusiya, İngiltərə, Yunanıstan, Bolqarıstan, Fransa, ABŞ, Finlandiya, Çin, Rumıniya, Avstriya, İtaliya, Türkiyə və başqa ölkələrin bir sıra Nəbatat bağları ilə toxum mübadiləsi aparır.